- معاون آب و آبفا ، رئیس هیات مدیره و مدیر عامل
- معاون وزیر و مدیر عامل شرکت : محمد جوانبخت
- حوزه مدیر عامل
- مدیر کل دفتر مدیر عامل و هیات مدیره و امور مجلس : مرتضی منشی زاده
- مدیر کل دفتر هماهنگی مدیریت بحران و پدافند غیر عامل : سیف اله آقابیگی
- مدیر کل دفتر حقوقی : حسین زمانی
- اداره کل حراست : علی بهمنش
- مدیر کل دفتر امور اجتماعی و روابط عمومی : محمد حسین رنجبران
- هسته گزینش : اسمعیل آقامحمد کاشی
- معاونت امور تلفیق و تنظیم گری
- معاون امور تلفیق و تنظیم گری : علیرضا الماسوندی
- مدیر کل دفتر اقتصاد و بهره وری آب ، مدیریت مصرف و تقاضا : محمد آهویی
- مدیر کل دفتر برنامه ریزی کلان منابع آب و تلفیق بودجه : عیسی بزرگ زاده
- مدیر کل دفتر توسعه نظام های فنی - بهره برداری و دیسپاچینگ برقابی : تقی عبادی
- معاونت مجامع ، توسعه مدیریت و پشتیبانی
- معاون مجامع ، توسعه مدیریت و پشتیبانی : مهدی دانشگر
- مدیر کل دفتر مجامع عمومی و نظارت مالی : شجاع حیدری راد
- مدیر کل دفتر تحقیق ، توسعه ، فناوری اطلاعات و امنیت فضای مجازی : مجتبی نوری
- مدیر کل اداره کل مالی و ذیحسابی : محمد رضا دشتی
- مدیر کل اداره کل منابع انسانی و پشتیبانی : حسین نوازنی
- حوضه های آبریز
- حوضه آبریز فلات مرکزی و شرقی
- رئیس حوضه آبریز فلات مرکزی و شرقی : علی پوراحمد
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : علی میرعربی
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : احمد حاج حسینی مسگر
- حوضه آبریز رودخانه کارون بزرگ
- رئیس حوضه آبریز رودخانه کارون بزرگ : فراز رابعی غلامی
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : کبری استیری
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : سید مهدی زندیان
- حوضه آبریز رودخانه زاینده رود
- رئیس حوضه آبریز رودخانه زاینده رود : علیرضا الماسوندی
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : علی میر عربی
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : علیرضا کریمی
- حوضه آبریز اترک و حوضه های شمالی
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : وحید مومنه
- حوضه آبریز رودخانه زهره - جراحی و حوضه های جنوبی
- رئیس حوضه آبریز رودخانه زهره - جراحی و حوضه های جنوبی : مهرزاد احسانی
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : مجتبی سهیلی
- معاون حفاظت ، بهره برداری امور اجتماعی : محمد حسین منتظریون
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : عباس جنگی
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی
- حوضه آبریز رودخانه سفید رود بزرگ
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : مجتبی کرد
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : رضا مومنی وصالیان
- حوضه آبریز رودخانه ارس
- رئیس حوضه آبریز رودخانه ارس : احمد قندهاری
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : غلامرضا فرهومند
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : امید زارعی منش
- حوضه آبریز دریاچه ارومیه
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : جواد حسن نژاد
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : فرهاد ایمان شعار
- حوضه آبریز رودخانه های کرخه و مرزی غرب
- رئیس حوضه آبریز رودخانه کرخه و مرزی غرب : شاهپور رجایی
- معاون مطالعات پایه و تخصیص : فیروز شکیبا
- معاون مهندسی و تامین منابع مالی : محمد رضا گلزاری
